Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms