Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms