Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms