Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPAT3Q53EU6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms