Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms