Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms