Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MICAQ29983 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICAQ29983 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms