Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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