Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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