Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms