Protein–RNA interactions for Protein: Q16625

OCLN, Occludin, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCLNQ16625 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OCLNQ16625 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms