Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NREPQ16612 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NREPQ16612 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NREPQ16612 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
NREPQ16612 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NREPQ16612 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NREPQ16612 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NREPQ16612 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NREPQ16612 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NREPQ16612 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NREPQ16612 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NREPQ16612 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NREPQ16612 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms