Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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ECM1Q16610 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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ECM1Q16610 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
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ECM1Q16610 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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ECM1Q16610 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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ECM1Q16610 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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ECM1Q16610 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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ECM1Q16610 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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