Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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