Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
E2F4Q16254 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E2F4Q16254 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E2F4Q16254 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
E2F4Q16254 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E2F4Q16254 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
E2F4Q16254 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.33■■□□□ 1
E2F4Q16254 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E2F4Q16254 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E2F4Q16254 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
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E2F4Q16254 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F4Q16254 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F4Q16254 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F4Q16254 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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E2F4Q16254 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F4Q16254 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F4Q16254 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F4Q16254 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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E2F4Q16254 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F4Q16254 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F4Q16254 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F4Q16254 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F4Q16254 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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E2F4Q16254 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F4Q16254 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F4Q16254 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F4Q16254 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F4Q16254 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F4Q16254 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F4Q16254 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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E2F4Q16254 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F4Q16254 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F4Q16254 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F4Q16254 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F4Q16254 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F4Q16254 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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E2F4Q16254 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
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E2F4Q16254 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F4Q16254 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F4Q16254 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F4Q16254 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F4Q16254 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F4Q16254 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F4Q16254 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F4Q16254 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F4Q16254 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F4Q16254 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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