Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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