Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIX1Q15475 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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