Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKD1Q15139 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKD1Q15139 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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