Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERV3-1Q14264 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERV3-1Q14264 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERV3-1Q14264 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERV3-1Q14264 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERV3-1Q14264 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERV3-1Q14264 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERV3-1Q14264 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERV3-1Q14264 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERV3-1Q14264 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERV3-1Q14264 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERV3-1Q14264 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERV3-1Q14264 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms