Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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