Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
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