Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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