Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN4PQ13434 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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