Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP140Q13342 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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SP140Q13342 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP140Q13342 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP140Q13342 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP140Q13342 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP140Q13342 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP140Q13342 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP140Q13342 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP140Q13342 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP140Q13342 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP140Q13342 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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SP140Q13342 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP140Q13342 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP140Q13342 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP140Q13342 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP140Q13342 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP140Q13342 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP140Q13342 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SP140Q13342 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP140Q13342 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP140Q13342 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP140Q13342 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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