Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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ERCC8Q13216 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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ERCC8Q13216 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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ERCC8Q13216 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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ERCC8Q13216 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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ERCC8Q13216 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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ERCC8Q13216 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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ERCC8Q13216 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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ERCC8Q13216 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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ERCC8Q13216 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
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ERCC8Q13216 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms