Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms