Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3Q12983 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms