Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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CNTN1Q12860 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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CNTN1Q12860 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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CNTN1Q12860 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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CNTN1Q12860 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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CNTN1Q12860 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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CNTN1Q12860 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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CNTN1Q12860 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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CNTN1Q12860 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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CNTN1Q12860 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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