Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms