Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms