Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms