Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREMQ03060 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREMQ03060 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREMQ03060 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREMQ03060 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREMQ03060 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREMQ03060 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREMQ03060 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREMQ03060 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREMQ03060 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREMQ03060 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREMQ03060 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREMQ03060 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREMQ03060 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CREMQ03060 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREMQ03060 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CREMQ03060 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CREMQ03060 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CREMQ03060 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CREMQ03060 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CREMQ03060 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CREMQ03060 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREMQ03060 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREMQ03060 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREMQ03060 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREMQ03060 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREMQ03060 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms