Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms