Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms