Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms