Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms