Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK6Q00534 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms