Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms