Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P63121 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms