Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB1P62873 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB1P62873 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms