Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPS29P62273 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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