Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms