Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSBP53539 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSBP53539 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOSBP53539 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOSBP53539 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOSBP53539 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOSBP53539 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOSBP53539 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOSBP53539 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOSBP53539 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOSBP53539 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOSBP53539 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOSBP53539 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOSBP53539 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOSBP53539 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOSBP53539 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOSBP53539 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOSBP53539 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOSBP53539 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOSBP53539 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOSBP53539 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FOSBP53539 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOSBP53539 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOSBP53539 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOSBP53539 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOSBP53539 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOSBP53539 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOSBP53539 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FOSBP53539 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOSBP53539 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOSBP53539 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOSBP53539 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOSBP53539 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOSBP53539 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOSBP53539 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOSBP53539 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOSBP53539 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOSBP53539 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOSBP53539 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOSBP53539 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOSBP53539 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms