Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCR4P51679 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCR4P51679 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCR4P51679 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCR4P51679 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCR4P51679 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCR4P51679 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCR4P51679 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCR4P51679 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCR4P51679 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCR4P51679 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCR4P51679 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCR4P51679 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCR4P51679 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCR4P51679 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCR4P51679 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCR4P51679 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCR4P51679 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCR4P51679 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCR4P51679 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCR4P51679 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCR4P51679 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCR4P51679 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCR4P51679 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCR4P51679 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCR4P51679 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms