Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms