Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGCXP38435 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGCXP38435 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGCXP38435 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGCXP38435 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGCXP38435 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGCXP38435 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGCXP38435 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
GGCXP38435 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGCXP38435 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGCXP38435 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGCXP38435 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGCXP38435 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGCXP38435 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGCXP38435 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGCXP38435 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms