Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP6P35125 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP6P35125 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP6P35125 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP6P35125 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP6P35125 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP6P35125 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP6P35125 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP6P35125 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP6P35125 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP6P35125 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP6P35125 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP6P35125 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP6P35125 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP6P35125 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP6P35125 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP6P35125 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP6P35125 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP6P35125 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP6P35125 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP6P35125 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP6P35125 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP6P35125 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP6P35125 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP6P35125 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP6P35125 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP6P35125 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP6P35125 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP6P35125 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP6P35125 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP6P35125 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP6P35125 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP6P35125 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP6P35125 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP6P35125 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP6P35125 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP6P35125 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP6P35125 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP6P35125 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP6P35125 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP6P35125 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP6P35125 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP6P35125 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP6P35125 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
USP6P35125 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP6P35125 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP6P35125 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms