Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTX2P32243 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX2P32243 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX2P32243 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX2P32243 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX2P32243 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX2P32243 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX2P32243 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX2P32243 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX2P32243 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX2P32243 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX2P32243 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX2P32243 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX2P32243 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX2P32243 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX2P32243 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX2P32243 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms