Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

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Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A5P29400 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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