Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms